科隆音樂學院始建於1845年，是德國第二古老的音樂學院，創始人是作曲家海因里希·多恩。1925年，學校引入了新的教學考試規章，成為德國第三所「國立音樂學院」，1945年後劃歸北威州管理。1972年，學校與位於Aachen和Wuppertal的音樂學院合併，成立了「萊茵國立音樂學院」。1987年學校更名為「科隆音樂學院」。至於現校名「科隆音樂與舞蹈學院」則由2009年開始使用。